自2005年在全国率先开展生态补偿机制探索以来，杭州市财政局加强探索、深化改革，形成了一套较为完备的生态保护补偿体系，有效缓解区域发展与生态保护的矛盾，助力缩小城乡区域差距。

一是持续优化纵向生态补偿机制。不断完善生态补偿资金盘子、分配办法、考核指标，更新出台《杭州市生态补偿专项资金使用管理办法（2023—2025）》，统筹用于各区、县（市）自然生态保护和建设，以及水、大气、土壤、固废等污染防治项目。近5年累计安排市级生态补偿专项资金8亿元，助力杭州市连续8年荣获美丽浙江考核优秀，7次荣获浙江省“五水共治”最高荣誉“大禹鼎”。

二是积极构建横向生态补偿机制。深入贯彻落实《关于深化省内流域横向生态保护补偿机制的实施意见》，杭州市域内流域上下游地区、省内跨行政区域上下游地区秉持生态保护补偿理念，以交接断面水质为基准，全部签订不低于800万元/年的流域上下游补偿协议，进一步健全共建共保、合作共赢机制。2023年市控以上断面水质优良比例达到100%，县级以上集中式饮用水水源地水质达标率保持100%。

三是合力深化跨省多级共担机制。推动浙皖两省签订共同建设新安江—千岛湖生态保护补偿样板区协议，明确按“基数+增长”模式予以推进，并提升了保护补偿资金筹措额度。预计自2024年起，浙江每年将出资不低于4亿元支持样板区建设，留杭部分按95:5比例分配至淳安县、建德市，用于两地生态保护、产业发展等方面。在多级共担机制下，两省交接断面安徽来水达到地表水Ⅱ类水质标准，千岛湖湖体水质总体保持优良，达到了双赢目的。

四是持续强化特别生态功能区建设。设立淳安特别生态功能区建设专项资金，2021—2025年，每年统筹安排5亿元全力支持淳安特别生态功能区建设，推动淳安“强村富民”与“四张清单”环保标准再提升。落实千岛湖配水工程水资源费市级分成返还政策，预计每年返还3000万元。淳安县生态环境持续保优，空气优良率达98.4%，森林蓄积量全省第一，2023年入选国家生态文明建设示范区。